舞台は2002年。最先端の海底超特急「マリン・エクスプレス」の開業を前に、招待客を乗せた試運転が行われようとしていた。その中には殺人犯を追う私立探偵、マリン・エクスプレスの破壊を計画するテロリスト、武器の密輸をたくらむ一団などがいて…。

「海底超特急 マリン・エクスプレス」は、手塚治虫原案の海洋スペクタクル作品です。海底を走る超特急が時間を超えて遥かなる過去へと向かいます。この作品は「24時間テレビ」放送のスペシャルアニメ第2弾として制作されました。また、スターシステムを採用しており、アトムやブラック・ジャック、サファイアなどの手塚漫画のキャラクターが「役者」として登場します。これらのキャラクターたちが織りなす物語は、視聴者を魅了すること間違いなしです。