ゲームが好きな武藤遊戯の祖父・双六が世界に４枚しかない超レアカード「青眼の白龍」を持っていることを知り、海馬はそれを奪うためにデュエルを仕掛ける。海馬が勝利し、双六のデッキは遊戯に託されることとなった。しばらく経ってからのこと、遊戯のもとに一通のビデオレターが届く。それはデュエルモンスターズの創設者であるペガサス・J・クロフォードからのものだった。千年アイテムを持つペガサスとデュエルした遊戯だが、戦略がすべて見透かされタイムオーバーで敗北してしまい、罰として双六の魂が封印されてしまう。遊戯は祖父を助けるため、ペガサス主催のデュエル大会に挑むことにする。

「遊☆戯☆王デュエルモンスターズ」は、カードゲームバトルを主軸に展開するTVアニメの第2弾です。物語は、主人公たちが様々な敵と対峙し、カードバトルを通じて成長していく様子を描いています。また、アニメオリジナルエピソードも多数放送され、その中で生まれたオリジナルキャラクターやカードも見どころの一つです。10カ月にわたる長期間に渡って放送されたこの作品は、その迫真のバトル描写と共に、多くのファンを魅了しました。