謎の宇宙船が早乙女研究所を急襲。ゲッターロボは宇宙船が送り込んできた空魔獣グランゲンを倒すものの、巴武蔵を失ってしまう。続いて宇宙船は羽田空港を占領。これに挑んだグレートマジンガーが苦戦していると、完成したばかりのゲッターロボGが現れ…。

「グレートマジンガー対ゲッターロボG 空中大激突」は、二大巨頭「グレートマジンガー」と「ゲッターロボG」が共演する劇場作品です。突如飛来した謎の宇宙船に対し、二大巨頭が挑むというストーリーが展開されます。特に注目すべきは、「ゲッターロボ」最終回で衝撃的な死を遂げた武蔵の、テレビ本編とは違う死にざまが描かれている点です。これにより、視聴者に新たな驚きと感動を提供します。