バージョンアップされたネットワークゲーム「The World R:2」。初めてそのゲームにログインしたハセヲだが、無法地帯と化した世界にプレイを続ける意欲をなくしてしまう。だが、オーヴァン率いる「黄昏の旅団」との出会いが何かを変えていく…。

".hack//Roots"は、人気の「.hack」シリーズのTVアニメ第3作目で、「G.U.」の起源を描いています。物語は、司やカイトたちがオンラインゲーム「The World」をプレイしていた時から6年後の世界を舞台に展開します。主人公は初心者プレイヤーで、彼はゲーム内で様々なキャラクターと出会い、交流を深めていきます。しかし、その過程で彼はゲーム世界を揺るがす大事件に巻き込まれていくことになります。この作品は、仮想世界と現実世界の境界を揺るがす物語を描いています。