新米の赤血球は、明るい職場紹介の映像を見て期待に胸を膨らませて研修に向かう。しかしそこでは、先輩にいきなり仕事を無茶振りされ戸惑うことに…！ とりあえず酸素を体内に運ぶも、そこで出会う各細胞たちは、職場紹介の映像とは打って変わって疲れ果てていた…。 飲酒、煙草、寝不足、ストレス、人間の体内という職場環境は、馬車馬のように働くことを要求されるブラック企業そのものだった…！ 好き放題過ごす人間たちの体内では、さまざまな細胞たちが決死の思いで働いている。そんな細胞たちは、どんなことを考え日々を過ごしているのだろうか？

「はたらく細胞BLACK」は、人気作「はたらく細胞」のスピンオフ作品です。今回の舞台は、飲酒や喫煙により超不健康な状態となった体内、いわゆるブラック職場です。体に悪影響を及ぼす環境で、細胞たちはどのような過酷な労働を強いられているのか、その中で起こるドラマが描かれます。ブラックな職場で働く細胞たちの思いや挑戦を通じて、健康への意識を改めて考えさせられる作品です。