世間を騒がせる怪盗ながら、暗号を織り交ぜた予告状とキザなセリフ、華麗な手口（ショー）で数々の名宝を盗み出し人気を博す“怪盗キッド”。そんな神出鬼没の大怪盗が誕生したのは……。江古田高校2年生、黒羽快斗。ある日、自宅にある隠し部屋を見つけ、世界的マジシャンだった父・黒羽盗一が実は世間をにぎわせていた〈怪盗キッド〉で、謎の組織に殺害されたことを知る。真相を探るため、快斗は盗一が遺した衣装を身に纏い2代目〈怪盗キッド〉となり、盗一が追っていた“伝説のビッグジュエル”と、“謎の組織”の正体に迫っていく…。巧妙な手口で数々の獲物を盗み出すキッドが新たに狙ったのは、伝説のアクアマリン“大海の奇跡（ブルー・ワンダー）”。キッド獲得に執念を燃やす園子の親戚・鈴木財閥相談役鈴木次郎吉は、ビッグジュエルを使いキッドに挑戦状を送りつけたのだ！次郎吉の挑戦に乗ったキッドは次郎吉・警察の警備をものともせず、いつものように鮮やかに盗み出すはずだったが、トリックを解き明かそうとコナンの名推理がはじまった！

原作青山剛昌氏、怪盗キッドの登場する回をまとめて制作されたもので、コナンと怪盗キッドのこれまでの展開が詰め込まれた怪盗キッドファン向けサービス回ともいえる作品。テーマソングはWANDSの「大胆」、コナンにとっての史上最大のライバルとの記憶を振り返るストーリー、劇場だけのグッズなど注目すべき点は満載。