主人公・笹波雲明（ささなみ うんめい）は「サッカーには消えてほしい」と願いながら、サッカーのない環境を求めて長崎にある南雲原（なぐもはら）中に転校してきた。一方、生まれ持った才能を発揮し、同世代たちの頂点に君臨する円堂ハルもまた、サッカーに対する複雑な想いを抱えていた。そんな2人の予期せぬ邂逅が、新たなる英雄たちの扉を開く――。

アニメとゲームのクロスメディア作品で「超次元サッカー」ブームを巻き起こした「イナズマイレブン」が、新たに映画として帰ってくる！新世代のストーリー「劇場版イナズマイレブン 新たなる英雄たちの序章」のアニメーション制作は、「呪術廻戦」や「チェンソーマン」など，数々のヒット作を生み出したMAPPAが担当。主人公の笹波雲明は、サッカーのない環境を求めて転校生として南雲原中学校にやってくる。一方、天才選手円堂ハルは、サッカーに対する複雑な感情を抱えている。二人の予期せぬ出会いが、新たな英雄たちの物語の幕を開けることになります。