殺人鬼ジェイソンを倒すも、そのショックで精神を病んだトミー。森の中にある施設で療養する彼だったが、周囲でホッケーマスクを被った者の手による殺人が起きる。その姿を目撃したトミーが精神的に追い詰められる中、一人、また一人と犠牲者は増える。

「新・13日の金曜日」は、シリーズ第5弾となるミステリー風味のホラー映画です。物語は、前作から6年後、ジェイソンを倒したトミーの周囲で起こる陰惨な事件を描いています。死んだはずのジェイソンが蘇ったのか、それとも別の犯人なのか、その正体を巡るミステリー要素が強調されています。しかし、流血シーンの描写は一切手抜きなく、観る者を恐怖の淵へと引き込みます。