薫を追いかけて船から海に飛び込み砂浜に打ち上げられた剣心。そこで比古清十郎と再会する。剣心は丸3日眠っていたが、薫が生きている保証はないと聞き落胆し、飛天御剣竜の奥義の伝授を比古に願い出る。その頃志々雄の乗った船が東京湾に到着し、政府重役たちとの会合が行われ剣心を指名手配にする。剣心は師匠から奥義を伝授されるが、足りないものがあることに気づかされる。その後奥義の心得を得て志々雄のもとへ向かうが、東京に戻ると警察の集団たちに囲まれ抵抗せずにとらわれるままになる。東京湾では剣心のさらし首の準備が進む中、ついに志々雄との決着の時なる！

「るろうに剣心 伝説の最期編」は、人気コミック原作のアクション時代劇シリーズの最終章です。シリーズ完結編となる本作では、最凶の敵・志々雄との壮絶な戦いが描かれます。炎をまとった刀で迫る志々雄に対し、主人公・剣心と仲間たちは死力を尽くして立ち向かいます。そのクライマックスの殺陣は、観る者の目を釘付けにするほどの迫力です。剣心が愛する者との再会を果たすため、どのような戦いを繰り広げるのか、その結末に注目です。