地底での大冒険から4年がたち17歳になったショーンは、謎の島からのメッセージを受けて、義父のハンクとともにその島を目指すことに。二人が道中で出会ったガイドのガバチョやその娘カイラニと共に向かったその島は、巨大なトカゲやハチ、小さな象など大きさが通常とは逆転した生物が存在し、金の山があるなどまさに神秘の島だった…！しかしその神秘の島は液状化現象によっていずれ沈んでしまうことが分かり…？！ショーン達一行は一刻も早く島から脱出するために、さまざまな危機を乗り越えながら島を大冒険する！はたしてショーン達は無事に帰還できるのか？！

「センター・オブ・ジ・アース2 神秘の島」は、ヴェルヌの小説「神秘の島」を元にした壮大なアドベンチャー映画です。今回の舞台は神秘的な島で、ノンストップのアドベンチャーが繰り広げられます。大小サイズが逆転した生き物たちや、伝説の潜水艦ノーチラス号が次々と登場し、まるでオモチャ箱をひっくり返したような賑やかさが魅力です。観る者を一瞬たりとも飽きさせない展開が待ち受けています。