室町時代、伏影城城主の結城光春は、家老である坂上主膳の謀略で命を落とし、その息子・重太郎は命からがら逃亡する。数年後、重太郎は主膳への復讐を試みるが、主膳の妹で忍者の螢火に重傷を負わされてしまう。その後、彼は影丸という忍者に救われ…。

「忍者武芸帳」は、白土三平の同名コミックを大島渚が映画化した作品です。原画をコマごとに撮影し、登場人物の声をアフレコするという実験的な手法が採用されています。この手法は、観る者に新鮮な驚きを与え、賛否両論を巻き起こしました。白土三平の作品である「カムイ外伝」でも知られるように、その独特な世界観とストーリーテリングは、この映画でも存分に生かされています。