父親のハリーが事故で亡くなったという知らせを受けた21歳のティムは、父親が住んでいたライムシティという街に向かった。ライムシティは、ポケモンと人間が共存する街だった。父親の荷物の整理をしようとしているところで、ティムは1匹のピカチュウと出会う。ティムには何故かピカチュウの言葉が成人男性の声に聞こえて、意思疎通ができた。記憶喪失のピカチュウは、自分はハリーのパートナーであったはずで、ハリーは生きているはずと言ってきて…。ティムとピカチュウは、ハリーが巻き込まれた事件の真相にたどり着けるのか？！

「名探偵ピカチュウ」は、ポケモン嫌いな青年と、中身がおっさんのピカチュウが共に謎を追うSFアドベンチャー作品です。リアルなポケモンたちの動物的なかわいさとキャラクター的な魅力が見どころで、観る者を引き込みます。物語は、父親を捜す青年とピカチュウの冒険を描き、笑いと驚き、そして感動の連続となっています。