「殺人魚フライングキラー」は、陸軍が開発した生物兵器のピラニアが海に出てトビウオと交配し、空飛ぶ殺人魚が誕生し、カリブ海のリゾート地を襲う物語。観光客やダイバーが惨殺される中、ダイビング講師のアンがフライングキラーの存在を突き止め、リゾートホテルの支配人に警告するも無視され、観光イベントが強行される。アンは密漁用のダイナマイトを使い、フライングキラーの棲家を破壊する決意をする。一方、アンの夫で沿岸警備隊員のスティーブは、息子がフライングキラーの棲家近くで遊んでいると知り、救助に向かう。