勝敗までも管理するサッカー管理組織「フィフスセクター」に反旗を翻し戦い続ける、松風天馬率いる雷門サッカー部。そんな中、フィフスセクターから強化合宿への参加命令がくだる。天馬たちは合宿場のある広大な自然が広がる島「ゴッドエデン」へと向かい…。

「劇場版イナズマイレブンGO 究極の絆 グリフォン」は、松風天馬を主人公に据えた劇場版シリーズの第2弾です。物語は、化身使いたちによる壮絶なバトルが勃発し、天馬たちが「本当のサッカー」で勝負に挑むところから始まります。彼らの目的は、管理組織から「本当のサッカー」を取り戻すこと。そのために、彼らは激しい化身バトルを展開します。脚本はレベルファイブの日野晃博が担当し、サッカーと友情、そして勝利への熱い思いを描いています。