名家に生まれ、名門校に通い成績優秀、心優しいが主体性に欠ける主人公。ある日、祖父の遺言によってなぜか女学院・聖應女学院に、転入生の少女・宮小路瑞穂として女装して通うことに。性別を偽り学園生活を送る彼に、どんな運命が待っているのか。

「乙女はお姉さまに恋してる」は、特殊な事情から女装男子が女学院に入学するという物語です。主人公は女装男子として、女生徒たちからお姉さまと慕われる存在となります。その特異な状況から生まれるハプニングや、ヒロインたちとの関係性が描かれており、それが見どころとなっています。学園ラブコメディの第一弾として、女装男子だからこそ描ける独特の展開が楽しめます。