ナチスに追い詰められた英国は日本と講和する。日本は戦艦日本武尊を中心とした旭日艦隊を英国に派遣。喜望峰沖で独海軍を破り、ドイツ本土を爆撃し、欧州解放に向けて順調に歩を進める。しかし独軍も新兵器を投入、反撃を開始するのだった。

「旭日の艦隊」は、「紺碧の艦隊」と同じ世界観を持つ架空戦記です。物語はヨーロッパを舞台に展開され、不沈の超戦艦が出撃します。主な敵はヒトラー率いる「ナチス第三帝国」で、彼らとの戦いを繰り広げる艦隊の活躍が描かれています。「紺碧の艦隊」とは表裏を成すもう一つの戦いを描く本作は、戦艦と戦争のドラマを鮮やかに描き出しています。