海底火山の噴火により、太平洋上に出現した新島で発見された記憶喪失の少年。アメリカでは、その少年を「マーズ」と呼び暗躍する男たちが現れる。一方日本政府と防衛庁は、少年と、島で発見された謎の遺跡に関係があると考えて調査を本格化させていく。

「マーズ」は、記憶を失った少年と襲い来る謎のロボットとの戦いを描いたメカニックアクションバトル作品です。原作は横山光輝のマンガで、一世を風靡した『六神合体ゴッドマーズ』の原作として知られています。しかし、本作は原作に忠実な内容でありながら、防衛庁や海上自衛隊といったオリジナル要素も取り入れています。地球の危機を描きつつ、少年の成長と友情、そして人間の可能性を問いかけるストーリーが展開されます。