野球のワールドカップでは惜しくもアメリカに敗れ、敗戦投手となった吾郎。しかしその奮闘ぶりからホーネッツの一員として迎えられる。そして迎えたメジャー初登板のデビュー戦。多くの人が見守る中で、吾郎は快調なピッチングを見せるが、「メジャー初先発でノーヒットノーラン」という記録が見えてくると、それまで好調だった吾郎に変化が訪れて…？！今までに経験したことのない苦しみのトンネルに入ってしまった吾郎。自分との戦いに勝利し、再びマウンドで活躍することができるのか？！そしてホーネッツのメンバーと優勝を手にすることはできるのか？！

「メジャー 第6シリーズ」は、主人公・吾郎がついに夢の舞台、メジャーリーグに進出した物語です。しかし、そこで彼を待ち受けていたのは、長く苦しい「自分との闘い」でした。メジャーリーガーとしてのシーズンを戦い抜く吾郎の姿を描く本作は、人気野球アニメ「メジャー」シリーズの最終章となります。吾郎の飽くなき挑戦が描かれ、視聴者を引きつけます。