港町の旅館「ベンボー亭」の息子、ジムは父親の書類箱から大海賊フリントの残した宝の地図を見つけた。その宝探しに旅立つトムとトリローニたちは、片足のコック・シルバーと親しくなる。だが、そんな彼こそが恐ろしい海賊の首領であった。

「新宝島」は、スティーヴンソンの名作冒険物語「宝島」を手塚治虫が翻訳し、キャラクターを動物に変えて再構築した作品です。日本初の1時間アニメとして製作され、海賊シルバーはオオカミ、主人公のジムはウサギといったように、登場人物全員が動物に変更されています。この独特な設定が、物語に新たな魅力をもたらしています。