川村メグミの依頼を受け、鬼太郎は南方のバルル島へ向かう。どうやらメグミの父親は「命の水」を盗もうとした日本人とともに南方妖怪に捕えられたらしい。しかし、探索に向かった鬼太郎は南方妖怪に捕まり、「命の水」を飲まされて大怪獣になってしまう。

「ゲゲゲの鬼太郎 大海獣」は、'96夏・東映アニメフェアで上映された「ゲゲゲの鬼太郎」第4期シリーズの劇場版第1弾です。物語は、勝手に振舞う日本人に怒りを抱いた南方妖怪たちが日本をパニックに陥れるところから始まります。その中で、主人公の鬼太郎が大怪獣に変身し、南方妖怪たちに立ち向かっていく様子が描かれています。鬼太郎の勇敢な戦いと、南方妖怪たちとの対立が織りなすドラマが展開されます。