こまちゃんは、クリスマスにパパとママに会えるのを楽しみにしていた。そんなとき、ふたりからクリスマスプレゼントが届く。しかし、そこには「クリスマスには帰れない」という手紙が。元気をなくしたこまちゃんに、発明少年・ラジボーがある提案をする。

「こまねこのクリスマス 迷子になったプレゼント」は、一生懸命でドジなネコの女の子・こまちゃんが主人公のクリスマススペシャル作品です。クリスマスに会えるのを楽しみにしていた両親からのプレゼントが届くところから物語は始まります。しかし、こまちゃんのドジさからプレゼントが迷子になってしまいます。こまちゃんの一生懸命さと思いが詰まった作品で、視聴者はこまちゃんの思いにほっこりとできます。