讃州中学校2年生の結城友奈は、大親友の東郷美森、部長の犬吠埼風、風の妹の樹の4人で「勇者部」として人々の役に立つ活動をして日々を過ごしていた。しかしある日突然、友奈たちは神樹が作る樹海に飛ばされ、「勇者」に選ばれたと告げられる。 バーテックスという敵が神樹にたどりつけば世界は滅亡すると聞かされた友奈たちは、戸惑いを隠せなかったが、勇者となりバーテックスに立ち向かい、神樹を守る決意を固める！これまでの平和な勇者活動とは違い、危険な闘いに挑むことを決めた勇者部のメンバーの運命はどうなるのか？！