世界的なレーサー・島村ジョーはレース中の事故で重傷を負ったが、悪の組織・ブラックゴーストに連れ去られ、サイボーグ戦士009として蘇った。しかし、ギルモア博士や8人のサイボーグと共に組織を脱出、ブラックゴーストと戦うことを決意する。

「サイボーグ009」は、SF漫画の巨匠、石ノ森章太郎の代表作を初めて映像化した作品です。9人のサイボーグ戦士が主人公で、彼らの活躍を描いたSFアクションです。モノクロ映像ながら、奇抜な発想と迫力あるダイナミックなアクションが魅力的で、記念すべき劇場版第1弾として観客を引きつけました。各キャラクターの個性と能力、そして団結力を活かした戦いが繰り広げられます。