「学園都市」に「エンデミュオン」という学園都市製宇宙エレベーターが開発されていた。「エンデミュオン」の完成が近づいてきた頃、当麻とインデックスは町で歌のストリートパフォーマンスをしていたアリサという少女に出会う。アリサの歌に聞き惚れた2人はアリサと仲良くなる。そしてそのアリサに「エンデミュオン」の開通式でイメージソングを歌うという大役が舞い込んでくる。そのお祝いをしている最中に、魔術師の集団がアリサを襲いだす。無能力者のアリサに、しかも「科学サイド」の人間なのに、アリサを襲う集団の意図がわからない当麻たちだった。

「劇場版 とある魔術の禁書目録-エンデュミオンの奇蹟-」は、学園都市製の宇宙エレベーター「エンデュミオン」を舞台に繰り広げられる物語です。その完成を目前に控えたある日、主人公の上条とインデックスは、鳴護アリサという少女と出会います。しかし、彼女の周りには謎が多く、やがて彼女を巡る陰謀が明らかになります。人気ファンタジーアクションシリーズの劇場版で、壮大なスケールと緻密なストーリー展開が魅力の作品です。