海底火山の噴火で生まれた平成新島を取材していた岩倉は、言葉も話せず身元も不明の少年・マーズを保護する。彼は、神々により地球に送りこまれ、いずれは地球を爆破する使命を帯びた存在だった。しかしマーズは人間に触れるうちに使命に疑問を感じ始め…。

「神世紀伝マーズ」は、横山光輝の漫画「マーズ」を原作としたSFアクションアニメです。眠りから目覚めた少年が地球を破壊するために立ち上がるというストーリーが展開されます。原作のアニメ化としては3作目にあたりますが、本作は一番原作ストーリーに忠実に作られています。現代世界を予言しているかのような奥深い物語も特徴的で、視聴者を引きつけます。