変わりない毎日に退屈していた少年・神原拓也は、弟の誕生日当日に謎のメールを受け取り、指示された渋谷駅地下にたどり着く。電車型のデジモン・トレイルモンは拓也と数人の少年少女を乗せてデジタルワールドにたどり着いた。感動していたのも束の間、突然デジモン・ケルベロモンの襲撃に会ってしまう。すると拓也は炎のスピリットに選ばれ、炎のデジモン・アグニモンに変身し圧倒的な強さでケルベロモンを倒すことができた。果たして拓也たちがデジタルワールドに連れてこられて理由とは？！子供たちは現実世界に戻ることができのか？！

「デジモンフロンティア」は、人間がデジモンへ進化するという新たなコンセプトを採用したデジモンシリーズの第4弾です。物語はデジタルワールドでの冒険を中心に進行し、前3作とは異なる異世界ファンタジーの要素が強く前面に押し出されています。スピリットエボリューションという新たな進化形態を通じて、人間とデジモンの境界が曖昧になり、より深い絆と冒険が描かれます。この新たな視点からデジモンと人間の関係性を探求し、デジモンシリーズの新たな魅力を引き立てています。