愛機マジンガーZを失った甲児は、祖父の兜十蔵の残した新たなマジンガー「マジンカイザー」を手に入れる。甲児は、マジンカイザーで再びドクターヘルの機械獣軍団に挑む！

「マジンカイザー」は、人類の平和を脅かすドクターヘルの機械獣軍団と戦う物語です。主人公のロボット、Ｚとグレートは、敵の猛攻の前に傷つき倒れてしまいます。しかし、その危機を救うために、新たなる力「マジンカイザー」が覚醒します。これは、人類の存亡を賭けた壮絶な戦いを描いた作品で、ロボットアニメの新たなる金字塔とも言える作品です。