アンパンマンにやられてばかりのばいきんまんは、どんな願いもかなえるメコイスのつぼのことを聞き探しに向かいます。その頃、同じつぼを探すヤーダ姫が一足先に見つけていました。ばいきんまんが襲いますが、ヤーダ姫の悲鳴でアンパンマンが駆けつけます！

「それいけ！アンパンマン ばいきんまんの逆襲」は、伝説の魔法のつぼの力で大魔王となったばいきんまんがアンパンマンに挑む物語です。ばいきんまんの逆襲にアンパンマンはどう立ち向かうのか、その結末は見逃せません。さらに、TVシリーズ以上のスケールで描かれる大冒険が観客を引きつけます。サブキャラクターたちも多数出演し、彼らがアンパンマンたちを応援するシーンは、観る者も一緒に応援したくなる感動的な瞬間です。大人気メルヘンの劇場版第2弾として、子供から大人まで楽しめる作品となっています。