ドクター・ヒヤリの弟子、ヒヤリコが作った「強くなるクスリ」を飲んで赤ちゃんになってしまったばいきんまん。元に戻る薬を作ろうとするヒヤリコですが薬は爆発、ばいきんまんは吹っ飛ばされてしまい…。やがてアンパンマン・ワールドのみんなも赤ちゃんに!?

「それいけ!アンパンマン ヒヤ・ヒヤ・ヒヤリコとばぶ・ばぶ・ばいきんまん」は、「それいけ！アンパンマン」劇場版第20弾の同時上映の短編作品です。物語は、何かとトラブルに巻き込まれるばいきんまんが主役。ある日、ばいきんまんが原因でみんなが赤ちゃんになってしまいます。ばいきんまんは元に戻れるのか、という問題が浮上します。この作品は、ばいきんまんの憎めない一面や、笑いを誘うエピソードが詰まっており、視聴者に愛すべき悪役としてのばいきんまんの魅力を再認識させます。