はるか宇宙のかなたにある砂の惑星で一角獣ハンターをなりわいとするA子とB子。ふたりはひょんなことから財閥令嬢のC子と知り合う。しかし犯罪組織の手先によってC子が拉致されてしまった。後を追うA子たちだったが、想定外の事態で仲間割れしてしまい…。

「A-ko The VS GREY SIDEBLUE SIDE」は、「プロジェクトA子」シリーズの外伝OVAで、A子たちが宇宙で大暴れする物語です。しかし、これまでのシリーズとはストーリー的なつながりはなく、メインキャラクターのA子たちを用いた新たな冒険が描かれています。大ヒットSFアクションコメディから一転、趣の異なるシリアスなSF冒険活劇として展開されます。これまでのコメディ要素を踏襲しつつも、新たな舞台での活躍を描くことで、視聴者に新鮮な驚きと興奮を提供します。