ナルトの故郷・木ノ葉隠れの里は「空の国」の忍に大攻撃を受けていた。それを聞きつけて急いで里に戻ったナルトたちだったが、もう時すでに遅かった。そして、破壊の調査をするうちに謎の遺跡を発見する。そこで死んだはずだった「神農」と出会ってしまう。実は、神農は「空の国」の長であり、存在を偽って世界を征服しようと目論んでいた。その神農と対決するナルトたちだったが、ナルトたちの力を奪う神農に苦戦するのであった。

「劇場版NARUTO-ナルト- 疾風伝 絆」は、人気忍者アクション劇場版の通算第5弾で、「絆」をテーマに描かれています。TVシリーズ第2期の劇場版第2弾として、ナルトたちから離れたサスケが再登場します。TVシリーズとは異なる形での再会が描かれ、その「絆」がふたりを再び闘いへといざないます。この作品は、絆と闘いを通じて、キャラクターたちの成長と深まる絆を描いています。