ラストオーダーを救った際に、脳に損傷を負ってしまったアクセラレータは療養で入院していた。そこにエステル・ローゼンタールという少女が現れるまでは平穏な入院生活だった。突如として現れたエステルは武装した男に狙われている様子。しかし体調が万全ではないアクセラレータは、関係のない問題に首を突っ込みたくなかった。しかし彼女が去った後に残された写真を見て驚く。そこにはラストオーダーの姿があったからだ。それで、事情を探るべくエステルの身柄を引き渡すように武装組織に要求するアクセラレータだったが、武装した男達は新型の機動兵器を持ち出してきたのだった。

「とある科学の一方通行」は、「とある」シリーズのスピンオフ作品で、最強にして最悪のダークヒーロー、アクセラレータの活躍を描いています。物語の舞台は学園都市の暗部で、アクセラレータは最強の超能力者として、様々な能力バトルに挑んでいきます。既存の設定を深掘りするだけでなく、新たな魅力も満載の作品です。本編の補完に留まらず、アクセラレータの戦いを通じて、学園都市の暗部とは何か、そして彼がどのようにして最強の地位を保ち続けるのかが描かれています。