デュエマが大好きな小学5年生・切札ジョーと、意志を持ったデッキケースのデッキーは、ある日夢のなかで不思議なお告げを聞いた。その後、切札家で見つけた謎の巻物をきっかけに、ジョーは仲間と一緒に伝説の12枚のカードを探すため、過去の世界へ旅に出る。

「デュエル・マスターズ キング!」は、主人公ジョーが伝説の12枚のカードを探すために過去の世界へと旅立つ物語です。デュエマの4000年の歴史を遡りながら、新たなカードや切札が登場し、デュエルの面白さが一層パワーアップします。伝説の12枚のカードがどのような能力を持っているのかが明らかになる過程も見どころの一つです。過去の世界での冒険を通じて、ジョーの成長とデュエルへの情熱を描いた作品となっています。