シーズン1の衝撃的な結末によって神聖時間軸は崩壊し、無数の時間軸が分岐、マルチバースは制御不能な大混乱に陥った。

次々に生まれる無数の世界の衝突により、もはや制御不能に。

「裏切り王子」ロキは謎のタイムスリップに引きずり込まれながらも、多元宇宙の危機に立ち向かう。

そしてマルチバース全体を脅かす新たな強大な敵に立ち向かうため、ロキの壮大なタイムトラベル・アドベンチャーが再び始まるのであった。

果たして彼は、崩壊寸前の世界を救えるのか。