「MIB」のエージェントコンビJとK。エイリアンたちの監視や取り締まりに日々追われていた。長い間二人でやってきたが、Jは単独で捜査に当たるKに不信感を覚える。問いただしても全く取り合わないK。次の日、どこを探してもKの姿が見えない。それどころか、上司から「Kは40年前に亡くなっている」との驚くべき言葉が。同じ頃、またしても地球に侵略してきたエイリアンたち。全ての謎を明らかにし、また地球を守るため、40年前にタイムスリップを試みることにしたJ。そこで明かされる、衝撃の事実とは……。

「メン・イン・ブラック3」は、地球に潜む宇宙人たちを監視するエージェント・コンビの活躍を描く人気シリーズの第3弾です。主演は前2作に続きW・スミスとT・リー・ジョーンズで、J・ブローリンが共演します。今回の舞台は1969年。タイムトラベルを通じて、意外な展開が待ち受けています。過去と現在が交錯する中で、エージェントたちは新たな謎と戦いに挑みます。