「ブラッディ・マンデイ」は、天才ハッカー・高木藤丸が最凶最悪のウイルステロに立ち向かう物語。普段は無気力な高校生だが、裏ではカリスマハッカー“ファルコン”として公安調査庁の一組織『THIRD-i』の仕事を手伝っている。極寒の地・ロシアで危険なウイルスを手に入れた謎の女テロリスト・折原マヤが藤丸の通う学院へ赴任し、特殊拘置所で収監されている宗教団体がテロ計画を実行に移そうとしていた。藤丸は、幼馴染の九条音弥の協力を得て、テロメンバーの折原マヤの逮捕に成功するが、内通者の存在が判明し、その正体を暴く。