「劇場版ポケットモンスター アドバンスジェネレーション ポケモンレンジャーと蒼海の王子 マナフィ」は、旅の途中で水の民の末裔ヒロミと出会ったサトシたちが、海賊ファントムから秘宝「海の王冠」を守るために奮闘する物語。ファントムは、ヒロミたちが保護していた「蒼海の王子」マナフィのタマゴを狙っていた。一方、ポケモンレンジャーのジャッキーは、マナフィの卵をファントムから守るために奮闘。ハルカは、マナフィの卵の不思議な力により、海底神殿「アクーシャ」へと導かれ、自らとマナフィの運命付けられた不思議なつながりに心をときめかせる。