「ピカチュウたんけんたい」は、偶然ポケモンだけが暮らす「ポケモン谷」に迷い込んだピカチュウたちの物語。一行は昼寝から目覚めたトゲピーが坂から転がっていってしまう様子を目撃し、あわてて追いかけるが、トゲピーはニャースと共に穴の中に落ちてしまう。心配しているところにコダックの押し出しによってピカチュウたちも穴の中に落ち、出た先がポケモン谷だった。そこでトゲピーがいなくなったことに気づき、大変な探し物が始まる。