筋金入りのヲタ女子たちが暮らす男子禁制のアパート・天水館。クラゲを愛してやまない主人公・倉下月海を始め、独自の青春を謳歌し自らを“尼～ず”と呼ぶ彼女たちの幸せな生活は、ある日美しい女装男子・鯉淵蔵之介の登場により少しずつ変化していく。

「海月姫」は、クラゲに魅せられたオタク女子・月海と、女装男子・蔵之介の出会いから始まる物語です。月海は男子禁制のアパートで、個性豊かなオタク女子たちと共に暮らしています。ある日、蔵之介との出会いをきっかけに、月海は自身の美しさに気づき、徐々に変化していきます。この作品は、月海の変身と成長を描いた、まさにシンデレラストーリーです。その過程で繰り広げられる彼女たちの日常と、蔵之介との交流を通じて見えてくる新たな自分自身の発見が魅力的です。