デッド・ムーンとの壮絶な戦いに勝ち、無事に高校生となったうさぎたちは新生活を楽しんでいた。しかしセーラー戦士が倒したデット・ムーンの女王ネヘレニアは、何者かの復讐をささやく声によって、再び力を得て蘇ってしまう…！再びセーラー戦士としてネヘレニアと対峙することになったうさぎたち。さらに地球の危機に、セーラーウラヌスら外部太陽系の戦士たちもセーラームーンのもとに集結し、ネヘレニアとのラストバトルに挑む。さらにそんなセーラー戦士たちの戦いを銀河から静かに見つめる何者かも登場し…？！