冬木市に住むごく普通の少女イリヤスフィールは、ある時カレイドステッキの精霊マジカルルビーに見定められて、強制的に契約を結ばされ、魔法少女プリズマイリヤに変身してしまう…！イリヤはカレイドステッキの本来の持ち主の遠坂凛に、冬木に眠るクラスカードを回収するように言われる。またイリヤと同じように、カレイドステッキの精霊マジカルサファイアと契約してしまった謎の美女、美遊も一緒にクラスカードの回収に当たることに。初めはギクシャクしていた二人だったが、ともに英霊たちと戦ううちに次第に友情が芽生えていく！

「Fate/kaleid liner プリズマ☆イリヤ」は、「Fate/Stay Night」のスピンオフ作品で、魔法少女アクションとして描かれています。主人公は、「Fate/Stay Night」に登場するイリヤスフィール・フォン・アインツベルン、通称イリヤ。彼女はこの作品では、明るくコミカルな性格で描かれ、平和な学園生活を送っています。しかし、その日常は突如として変わり、彼女は魔法少女としての戦いに巻き込まれていきます。この作品は、イリヤの新たな一面と、彼女が直面する困難を描いています。