ロブナスIIから生還を果たしたジンは、ラフィールとハイド星系を目指していた。狩人作戦によりジントの領地のハイド伯国、そして故郷である惑星マーティンが帝国領に復帰していたのだ。だが奪還されたばかりの惑星マーティンは帝国からの独立を画策していた。

「星界の戦旗III」は、主人公ジントが故郷の未来のために孤独な戦場へと赴く物語です。彼の故郷への深い愛情と、その未来を守るための決意が描かれています。ジントの選択と行動が、彼自身だけでなく、故郷の運命をも左右します。彼の戦いは、ただの戦争ではなく、故郷とその人々の未来を賭けた戦いです。その結果、視聴者はジントの成長とともに、彼の故郷の未来も見守ることになります。