沈没船から見つかった旧文明の記録にあった人類の姿は、レドの心に暗い影を落とす…。そんな中、正体不明の船団がガルガンティアに襲来。しかもエイミーが誘拐されてしまう。リーマは強大な力を秘める謎の人型戦闘機械を起動させるが…。

「翠星のガルガンティア ～めぐる航路、遥か～ 後編」は、大人気SFロボット冒険活劇の後日談となる作品です。船団都市を舞台に繰り広げられるオリジナルSF冒険活劇で、TVシリーズが大好評のまま終了した後の物語を描いています。オリジナルスタッフとキャストが再び集結し、翠星の使者としての決断の時を描き出しています。後編では、さらに深まる物語とキャラクターたちの成長が描かれ、視聴者を引き込む内容となっています。