ヒース・オスロ暗殺に失敗した雄二は行方不明となり、さらに世間にはテロ事件の首謀者として報道されてしまう。美浜学園で彼を待っていた少女たちは事件の真相究明に乗り出し、雄二の救出を目指すことに。安寧の日々は終わりを告げ、最大の敵との戦いに挑む。

「グリザイアの楽園」は、過去の因縁に決着をつけるためのミリタリーアクションが展開される作品です。シリーズ完結編として、前2作までの主人公・風見雄二の驚異的な強さによるアクションが主体でしたが、本作ではヒロインたちそれぞれの目覚ましい活躍が描かれます。各ヒロインが得意分野を活かした戦いを繰り広げ、その成長を感じ取ることができます。これまでのシリーズを締めくくる壮大な物語が展開され、視聴者を引きつけます。