ハートランド学園に通う中学一年生の九十九遊馬は正義感が強く、未来のデュエル・チャンピオンを目指し「かっとビング！」を合言葉に何事にも全力で立ち向かっていた。とはいえ、デュエルの腕前は初心者レベルである。ある日、友だちの鉄男のデッキがシャークに奪われてしまった。学校一の不良シャークにも恐れずに立ち向かう遊馬だが、行方不明の両親の形見として大切にしていた鍵を壊されてしまう。そのうえシャークとデュエルすることになったのだが、強力なモンスターを招集するシャークの前に遊馬は追い込まれてしまう。そんな中、突然遊馬の前に「アストラル」という謎の生命体が現れる。

『遊☆戯☆王ZEXAL』は、『遊☆戯☆王』シリーズ第4弾で、ナンバーズ・カードを巡る戦いが描かれています。初心者レベルのデュエルの腕前を持つ主人公・遊馬が仲間と共に成長していく姿が描かれており、その魅力が詰まっています。新ルール「エクシーズ召喚」の追加や、「ARデュエル」がテーマのデュエルシーンは見どころの一つです。遊馬の成長と共に物語が進行し、視聴者を引き込むストーリー展開となっています。