小学5年生の花丘イサミ、月影トシ、雪見ソウシは、実は幕末に活躍した新選組の子孫。ある日、新選組の秘密基地を発見したイサミたちは、先祖が残した不思議な宝物を手に入れた。それをきっかけに、悪の秘密組織・黒天狗党との果てしない戦いが幕を開ける。

「飛べ!イサミ」は、新選組の子孫たちが主人公となり、悪の組織と戦う壮大な物語です。彼らは先祖が残した宝を使い、正義のために立ち上がります。物語は進むにつれて、子供たちは変身する能力を得て、さらに深みを増していきます。新選組をテーマにしたこの作品は、その独自の展開により視聴者を飽きさせません。ワクワクが止まらない展開が魅力の一つとなっています。