江戸城本丸は南野小学校に通う5年生の男の子。勉強もスポーツもパッとしないが、同級生の美少女･河合伊代菜に密かに想いを寄せている。ある日、クラスの席替えで乱暴者のじゃば夫の隣になって、本丸はすっかり困ってしまう。すると、絵本作家の父から借りていた魔法の本が反応し、中から不思議な男の子が飛び出してきた!「たるる♪ 我こそは大魔法使いタルるート様だあ!」そのタルるートくんは、本丸の願いごとを叶えてくれるという。半信半疑の本丸は、こんな願いごとをする。「ぼくの友だちになってください!」こうして友だちになった二人は、学校で街でご近所で、摩訶不思議な大騒ぎを次々と巻き起こしてゆく。どんな騒ぎかって? それは見てのお楽しみ。

「まじかる★タルるートくん」は、平凡な小学5年生・江戸城本丸が、父から借りた魔法の本から飛び出してきた大魔法使い・タルるートくんと出会う物語。本丸の願い「友だちになってください」を叶えるためにタルるートくんが同居を始め、二人は学校や街で摩訶不思議な騒動を巻き起こす。タルるートくんの持つ様々な呪文や魔法アイテムを駆使しながら、本丸とタルるートくんは本当の友だちになっていく。