ガルズオルムとの最終決戦――プロジェクト・リザレクション――を完遂したセレブラントたちは、世界各地の残存部隊との戦いを続けていた。セレブラントとして舞浜サーバーを守った「ソゴル・キョウ」は、雪が降りしきる冬の舞浜で目を覚ます。「ずっと夏にいた気がする……記憶の欠損に困惑するキョウだったが、そこに新たな脅威・オルタモーダが出現する。自らをヒカリタツモノと名乗る「ハル・ヴェルト」はサブスタンスシェイドと呼ばれる未知の能力で襲ってくる。AI「ルーパ」の助けにより、これまでの記憶をダウンロードしたキョウは光対装備で対抗することになるが、これは互いの世界と存在をかけた戦いのほんの序章に過ぎなかった……。

「ゼーガペインSTA」は、2006年に放送されたサンライズ制作のオリジナルテレビアニメシリーズ「ゼーガペイン」の後日譚を描いた劇場版アニメ。作品はアニメ「ゼーガペイン」と「ゼーガペイン ADP」を振り返る「レミニセンス編」と、アニメシリーズの後日譚を描く「オルタモーダ編」の2部構成。ガルズオルムとの最終決戦後、世界各地の残存部隊と戦うセレブラントのソゴル・キョウの前に新たな敵が現れる。監督は「ゼーガペイン ADP」も手掛けた下田正美が務め、ボイスキャストには浅沼晋太郎、花澤香菜、川澄綾子、朴路美、久野美咲など豪華なメンバーが揃う。