銀河道路交通違反で逮捕されてしまったマイペースな強化人間の九条千春（チハル）と好戦的なサイボーグの来栖真希奈（マキナ）。

罰として社会奉仕活動を課された2人は惑星間走行列車（ミルキー☆サブウェイ）の清掃作業にあたっていた。

誰にでもできる仕事のはずだったが大きなトラブルに巻き込まれてしまう。

それはやがて宇宙空間にまで影響を及ぼす危機に発展していく大事件となり…。

果たして2人はノリでこの困難を乗り切れるか！？