「群青のマグメル」は、突如現れた新大陸・マグメルを舞台に、未知の生物や資源が眠るこの地で、探検家たちの救助を生業とする少年・因又の物語。数十年前に突如現れた新大陸で消息を絶った探検家の救助を行う彼の前には、未知の危険、人間たちの欲望、そして多くの謎が立ちはだかる。世界が再び探検家時代に突入したこの時代、因又は欲望渦巻くマグメルで何を見つけ出すのか。